More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0651 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  55.17 
 
 		 147 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.37 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  30.88 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  28.89 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  32.41 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  28.91 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  29.23 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.78 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.78 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.78 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.78 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.78 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  34.18 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.18 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  27.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  24.46 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  27.48 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  27.82 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  32.26 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>