More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1523 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  76.64 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  36.89 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.64 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.64 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  31.78 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  31.78 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  35.35 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 162 aa  67  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  31.25 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.75 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  33.86 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  34.96 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  35.79 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  34.17 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  30.63 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>