More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1190 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 182 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.68 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  34.96 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.07 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  25.58 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  26.43 
 
 		 324 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  30.93 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  23.89 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  27.64 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>