More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4406 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
168 aa  338  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  42.54 
 
 
154 aa  111  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  43.2 
 
 
147 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  36.67 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  36.13 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
136 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
150 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
146 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
151 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.71 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  30.61 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  31.5 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  31.5 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
219 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
200 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  31.5 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
147 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
139 aa  58.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  30.6 
 
 
181 aa  57.4  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1674  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>