282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1674 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1674  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
173 aa  344  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  41.5 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
152 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
152 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
152 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
152 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 
168 aa  57.4  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 
145 aa  57.4  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
142 aa  54.7  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
155 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31.18 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  34.81 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
180 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  36.63 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  34.31 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  34.62 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.84 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
151 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
151 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
150 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
172 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
157 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  29.75 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 
158 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  34.96 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 
177 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
164 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 
140 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
162 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 
153 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
156 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
411 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  36.36 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>