More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0546 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
172 aa  353  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
172 aa  353  7.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  99.42 
 
 
172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  99.42 
 
 
172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  98.26 
 
 
172 aa  348  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  98.26 
 
 
172 aa  348  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  98.26 
 
 
172 aa  348  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  92.22 
 
 
200 aa  320  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  92.22 
 
 
219 aa  320  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  36.96 
 
 
214 aa  94.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  36.28 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  33.93 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
144 aa  61.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
138 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  32.45 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  30.32 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  27.92 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 
140 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  27.52 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
147 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 
175 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.74 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
149 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
139 aa  57.8  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.81 
 
 
138 aa  57.4  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
148 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
191 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
191 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  25.79 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  41.1 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  28.95 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  24.48 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
233 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>