More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0270 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  58.33 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  42.73 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  33.9 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  26.06 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  35.63 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  23.19 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  23.76 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  25.93 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  23.76 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  24.49 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.32 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  23.08 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>