More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0111 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  278  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  97.89 
 
 		 142 aa  272  9e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  37.35 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  29.06 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  43.75 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.07 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  30.19 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.84 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  33 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  37.04 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>