More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3371 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  73.75 
 
 		 160 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  43.37 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 325 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.04 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.04 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 336 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2219  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 326 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  34.92 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.63 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  54.9 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.79 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  30.17 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  42.35 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  41.1 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  34.86 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>