More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1703 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  54.49 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  51.95 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  36.24 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.99 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  35.57 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.5 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 163 aa  85.5  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.12 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  29.1 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.56 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  32.74 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  30.32 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.82 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  31.73 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.19 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  22.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  22.46 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.95 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>