More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2399 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  99.36 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  81.41 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  76.62 
 
 		 162 aa  230  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  81.02 
 
 		 162 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  75.37 
 
 		 161 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  39.49 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 171 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  91.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.33 
 
 		 178 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.98 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  34.9 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  32.84 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.13 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.02 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  29.09 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  28.36 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.17 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.77 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>