More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0666 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
169 aa  329  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.24 
 
 
157 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.21 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.58 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  31.34 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.47 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 
162 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  37.08 
 
 
287 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  34.07 
 
 
109 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
149 aa  58.2  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
150 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
151 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
151 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
193 aa  57.4  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  29.5 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
303 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
157 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
145 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 
158 aa  54.3  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
159 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  26.56 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
155 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  27.21 
 
 
151 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.85 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  31.9 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
159 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
159 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  31.58 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  33.33 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
150 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  22.79 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>