More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0603 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  69.66 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  64.58 
 
 		 163 aa  190  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  36.77 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  39.55 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.55 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 171 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.69 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  37.78 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  38.13 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.09 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  34.81 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  33.07 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.29 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  42.25 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  42.25 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.95 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.97 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0187  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  37.86 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  31.71 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>