224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0482 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  80.98 
 
 		 163 aa  238  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0510  transcriptional regulator, MarR family  84.57 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  24.09 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  28.8 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.36 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  28.8 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  29.17 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  32.17 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 326 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 321 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 326 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 326 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.26 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  28 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  18.18 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  28.07 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  25.74 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  27.54 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  21.21 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  23.71 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>