241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6104 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  99.39 
 
 		 326 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  92.02 
 
 		 326 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  83.28 
 
 		 325 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 326 aa  530  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  77.54 
 
 		 336 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 321 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  67.81 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  49.03 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.45 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.57 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.39 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.9 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.67 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.77 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.65 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.85 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.85 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  28.18 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.32 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.62 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  33.33 
 
 		 848 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 347 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 309 aa  89.7  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 		 166 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.92 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01922  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  51.39 
 
 		 74 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0828281  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  24.05 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  26.03 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  23.97 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.93 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  32.43 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30.7 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.99 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 153 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 169 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  37.62 
 
 		 170 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 160 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 154 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  27.02 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 146 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.59 
 
 		 142 aa  50.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 155 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 152 aa  49.3  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.62 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 156 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 161 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 149 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 167 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 160 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 168 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 141 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 141 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>