More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1419 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  32.69 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 173 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  29.85 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  25.22 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  36 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1674  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 165 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  40.26 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  22.58 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>