More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1642 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 150 aa  309  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  69.18 
 
 		 146 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  26.28 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  27.41 
 
 		 324 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 192 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 192 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.91 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.93 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.69 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  27.68 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  29.2 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  25.55 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>