More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4634 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 324 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  64.83 
 
 		 147 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  61.11 
 
 		 145 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  61.11 
 
 		 145 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  61.81 
 
 		 145 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  60.54 
 
 		 148 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  60.42 
 
 		 145 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  60.69 
 
 		 145 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  56.58 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  60.42 
 
 		 145 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  60.27 
 
 		 146 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  52.45 
 
 		 146 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  57.04 
 
 		 140 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  56.64 
 
 		 144 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  55.71 
 
 		 140 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  54.81 
 
 		 143 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  50.34 
 
 		 147 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  51.63 
 
 		 153 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  57.02 
 
 		 144 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  44.19 
 
 		 134 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  40.94 
 
 		 138 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  38.93 
 
 		 135 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 183 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  40.31 
 
 		 177 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  36.64 
 
 		 135 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  38.28 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.32 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  37.88 
 
 		 140 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  37.98 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  40.56 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  37.01 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  41.07 
 
 		 163 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  36.09 
 
 		 145 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  39.82 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  40.15 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  34.97 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  38.89 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  34.96 
 
 		 164 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  37.96 
 
 		 159 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  39.81 
 
 		 119 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  35.96 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  35.96 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  35.78 
 
 		 168 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  38.98 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  35.96 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  40.52 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  38.98 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  34.33 
 
 		 164 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  33.64 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  34.78 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  32.23 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.8 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  32.8 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  35.59 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  30.07 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  33.87 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  32.31 
 
 		 150 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  36.79 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  37.27 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  36.79 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  37.27 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  36.79 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  37.27 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  32.09 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  28.87 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  33.9 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  36.94 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  35.45 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  32.31 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  35.45 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2738  hypothetical protein  27.86 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0877362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>