More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0300 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  71.85 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  71.11 
 
 		 138 aa  190  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  38.81 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  37.31 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  43.68 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  50.75 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.33 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  33.96 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  31.36 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.08 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.67 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 193 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.67 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  36.19 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  31.15 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.27 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>