More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4315 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  373  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  35.67 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.31 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  38.14 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 170 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  38.14 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  36.7 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  30.72 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  40 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  37.38 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  37.38 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  37.38 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  37.38 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  32.62 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  37 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  28.97 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  37.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  33.64 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  49.12 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.8 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>