More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0164 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  84 
 
 		 152 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  74.17 
 
 		 151 aa  221  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  47.86 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.61 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.11 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.12 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.94 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.46 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 303 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  25.36 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  29.46 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>