More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3893 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  300  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.59 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  38.55 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  38.55 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  38.55 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  38.55 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  38.55 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 201 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.01 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  33.59 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>