More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1143 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.6 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 149 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.77 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.63 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  27.56 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.33 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.97 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>