More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3704 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  352  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  58.99 
 
 		 153 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  44.16 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  43.26 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 158 aa  90.9  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 315 aa  89  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  30.2 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  37.62 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  32.31 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  32.31 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  32.31 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  32.31 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  33.33 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  28.15 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  34.4 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>