More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2466 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 145 aa  275  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  63.36 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  51.08 
 
 		 140 aa  126  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  45.11 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  45.05 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  40.23 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  38.38 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  43.68 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  33.63 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  37.76 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 199 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  42.71 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  40.34 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.6 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.6 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.94 
 
 		 287 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  37.17 
 
 		 292 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  34.58 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  35.57 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.23 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.71 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  35.97 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  39.36 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.63 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>