More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5066 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 158 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  54.74 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  52.52 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 158 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 189 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.45 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  31.75 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  31.29 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.56 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 188 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  35.65 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.35 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 315 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 176 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  29.13 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  26.15 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  29.52 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  26.21 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  25.24 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 164 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  35.29 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>