More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4592 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
152 aa  287  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  56.62 
 
 
158 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  55.94 
 
 
152 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  52.94 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  47.92 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
150 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  48.74 
 
 
167 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 
159 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 
157 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
303 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  44.12 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  37.74 
 
 
287 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
168 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
174 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
205 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  44.66 
 
 
199 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 
193 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
171 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
168 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  44.95 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.29 
 
 
162 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>