More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1914 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  299  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  299  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  93.29 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  93.29 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  92.62 
 
 		 149 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  92.62 
 
 		 149 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  90.6 
 
 		 149 aa  274  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  203  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 151 aa  203  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 173 aa  201  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 149 aa  197  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  59.73 
 
 		 149 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  33.83 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  28.47 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  30.6 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  28.78 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  29.66 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  32.12 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  34.68 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  26 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.87 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  28.68 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2666  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>