More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4960 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  54.17 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  51.37 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  48.23 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  46.62 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  55.81 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  47.79 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  31.29 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  38.3 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.85 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 303 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  36.64 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  32.74 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.63 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.12 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.12 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.12 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.12 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.12 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.12 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.02 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.12 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  37.21 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  27.18 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.56 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.34 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.34 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.9 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.34 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.34 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.34 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>