215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1929 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  44.68 
 
 		 144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  42.03 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  49.23 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  44.2 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  47.45 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  38.1 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.23 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 190 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 303 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 194 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  25.35 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  31.78 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 158 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0265  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  30.4 
 
 		 287 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 292 aa  47  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  30.77 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.82 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>