42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0265 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0265  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1998  MarR family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 154 aa  290  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3512  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  26.61 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.34 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  24.41 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  28.74 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  25 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  27.22 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0833  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  26.97 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  38.46 
 
 		 213 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>