More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2322 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 174 aa  337  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.57 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  38.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  38.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  38.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  38.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  38.3 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 292 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  38.3 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  34.68 
 
 		 137 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  41.11 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  36.94 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  33.81 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  37.23 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  37.23 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>