278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3181 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 176 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.97 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  23.65 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  38.71 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  30.4 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  30.4 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  30.16 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  32.74 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  30.4 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  28.79 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  26.75 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.8 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  34.41 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  34.41 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  34.41 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  34.41 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  34.41 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  34.41 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  34.41 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  30.97 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  31.5 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  26.67 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  33.6 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  35.48 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  35.48 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  35.48 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  30.65 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  28.04 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  22.52 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  23.61 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  26.23 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>