More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3404 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 120 aa  246  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  67.29 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  41.59 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  41.59 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 173 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.7 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.21 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 170 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.94 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  29.31 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  32.17 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.59 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  27.59 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  25.44 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>