More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3655 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 176 aa  174  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  55.28 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  54.04 
 
 		 167 aa  168  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  55.26 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  36.08 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  29.94 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  43.56 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  34.04 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  37.69 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  33.74 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  32.58 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.59 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  31.82 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.48 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  33.03 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  38.46 
 
 		 261 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  30 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.33 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  32.69 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.33 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  30.77 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  38.52 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  49.33 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>