More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3051 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 137 aa  280  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  68.64 
 
 		 120 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  36.04 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  30.23 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  29.66 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  27.56 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 156 aa  57  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>