More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2022 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  89.68 
 
 		 155 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  76.35 
 
 		 173 aa  229  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.51 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.51 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.08 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.4 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  35.96 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.55 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  34.34 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  36.11 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  33.7 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  34.44 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  36.14 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 325 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 326 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  32.93 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>