202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7562 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
326 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  91.72 
 
 
326 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  92.02 
 
 
326 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  92.02 
 
 
326 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  81.73 
 
 
325 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  81.17 
 
 
326 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  78.44 
 
 
336 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  75 
 
 
321 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  67.81 
 
 
329 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  47.73 
 
 
313 aa  275  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
337 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.77 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
321 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
306 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
314 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
315 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.9 
 
 
322 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
305 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  32.27 
 
 
318 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
309 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
314 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.84 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
316 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.67 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.64 
 
 
305 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
299 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.84 
 
 
311 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
310 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
308 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
320 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.74 
 
 
305 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.03 
 
 
310 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.64 
 
 
304 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  28.57 
 
 
312 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
347 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  33.95 
 
 
848 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.03 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.3 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
307 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 
322 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
309 aa  89.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
166 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.91 
 
 
308 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
347 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01922  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50 
 
 
74 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0828281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25.65 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  23.02 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  23.37 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  33.11 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
161 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
161 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
154 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
162 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
155 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.73 
 
 
283 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
162 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 
150 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.83 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
172 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
152 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
143 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.82 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
153 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
172 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30.17 
 
 
150 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
180 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  36.63 
 
 
170 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
167 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.41 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 
158 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
160 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
156 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
174 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
160 aa  49.7  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
169 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.41 
 
 
142 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
167 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
141 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
141 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  22.5 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
165 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
172 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>