More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4490 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  337  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 167 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 185 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  61.33 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 161 aa  173  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  57.14 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  55.17 
 
 		 201 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 203 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  53.79 
 
 		 194 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  53.79 
 
 		 194 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 175 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30.5 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  30.95 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.48 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  31.2 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  31.82 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 309 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  27.5 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>