More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0701 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.63 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.55 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.55 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.55 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.55 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  26.55 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  26.67 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  26.67 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.79 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.71 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.59 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.66 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  27.61 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  36.96 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0946  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.34 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 307 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>