More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2089 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 159 aa  319  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  95.36 
 
 		 168 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  96.23 
 
 		 154 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  93.75 
 
 		 149 aa  276  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 153 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  84.28 
 
 		 153 aa  257  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  84.28 
 
 		 153 aa  257  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  84.28 
 
 		 153 aa  257  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  68.61 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 		 138 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  56.72 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  52.27 
 
 		 138 aa  154  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  54.62 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  32.17 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  37.5 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>