145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  273  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 187 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  36.11 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  26.83 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  24.51 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  35.44 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  39.47 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  23.3 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  35.58 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 146 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 168 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 159 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 147 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  39.62 
 
 		 142 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 162 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 140 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  29.84 
 
 		 171 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 157 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 157 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>