More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6069 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  280  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  38.68 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  42.55 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.94 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.78 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  35.97 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  37.38 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 325 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  34.31 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 175 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 326 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 326 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 326 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>