More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0318 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 153 aa  310  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  60.14 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  60.14 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 352 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.97 
 
 		 283 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.2 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.47 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  41.77 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  29.84 
 
 		 312 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 322 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 321 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 326 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 320 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 326 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.44 
 
 		 312 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 347 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 340 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 340 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 313 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 309 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  30.08 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 326 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 325 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 314 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.09 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 		 301 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.78 
 
 		 326 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.73 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 326 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  35.44 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 336 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 309 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>