296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4567 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  87.1 
 
 		 186 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  46.07 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 189 aa  160  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 188 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 270 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 270 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 148 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  38.89 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  37.78 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  27.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  30.48 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  24.19 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  30.56 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  27.21 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  36.73 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  32.14 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 314 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>