More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1008 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  303  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  85.14 
 
 		 149 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  86.86 
 
 		 149 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 149 aa  208  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 149 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 149 aa  206  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 149 aa  206  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 149 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  67.38 
 
 		 149 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  68.53 
 
 		 173 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 138 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  27.97 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.6 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.5 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  32.14 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 183 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  27.61 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.2 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  38.14 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.42 
 
 		 304 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  31.78 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  27.66 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1398  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 312 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  28.47 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  31.78 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 178 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>