267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3960 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  81.16 
 
 		 139 aa  235  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  57.97 
 
 		 138 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  57.97 
 
 		 138 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1151  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  54.01 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 138 aa  153  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  44.05 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0194  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.55 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.26 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  24.14 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 154 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  34.09 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 154 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  35.77 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.16 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.16 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  35.9 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  29.6 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  26.23 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>