253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2960 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  25.19 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  25.19 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  40.48 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 314 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  33.59 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 325 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 133 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 329 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  39.44 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 168 aa  47.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 141 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  21.99 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1561  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  22.66 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.86 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  45.61 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 138 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 321 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 326 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.75 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0226  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000277932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  30.51 
 
 		 132 aa  44.7  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 167 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>