288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0769 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  65.88 
 
 
322 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  62.82 
 
 
340 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 
320 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  61.24 
 
 
349 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  61.24 
 
 
349 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  60.91 
 
 
347 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  59.8 
 
 
334 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  60.26 
 
 
312 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  61.31 
 
 
309 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  62.42 
 
 
347 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  62.18 
 
 
340 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  62.18 
 
 
326 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  57.1 
 
 
352 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  53.36 
 
 
283 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  53 
 
 
301 aa  309  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
326 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  66.03 
 
 
170 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
307 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  62.82 
 
 
173 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  62.42 
 
 
177 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  62.42 
 
 
167 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  62.42 
 
 
167 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  60.51 
 
 
167 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  60.74 
 
 
167 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  61.78 
 
 
167 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  60.51 
 
 
167 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  59.51 
 
 
167 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  57.69 
 
 
167 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  62.42 
 
 
167 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  62.42 
 
 
167 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  62.42 
 
 
167 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  62.42 
 
 
167 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  61.78 
 
 
167 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  60.74 
 
 
167 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  60.12 
 
 
167 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  60.12 
 
 
167 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  60.12 
 
 
167 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  60.12 
 
 
167 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  60.12 
 
 
167 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  59.87 
 
 
172 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  57.69 
 
 
167 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  43.23 
 
 
161 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
161 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  39.62 
 
 
160 aa  132  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  42.04 
 
 
163 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  38.36 
 
 
164 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  41.4 
 
 
162 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 
161 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  27.96 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
326 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  26.16 
 
 
309 aa  86.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
160 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  36.48 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  36.25 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  25.09 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  23.32 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.46 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  25.09 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.1 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.32 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.14 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  25.53 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  23.93 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  24.36 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.91 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.53 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.91 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  34.43 
 
 
151 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.49 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  34.43 
 
 
151 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  34.07 
 
 
387 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
291 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.37 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  22.92 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.44 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.71 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  35.35 
 
 
160 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>