More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1903 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  94.63 
 
 		 149 aa  285  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  86.86 
 
 		 151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 173 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  74.62 
 
 		 138 aa  207  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  64.54 
 
 		 149 aa  199  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 149 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 149 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 160 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.32 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  32.33 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  37.38 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  28.15 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.15 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  30.71 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02537  putative regulatory protein, MarR  26.47 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.83 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  31.08 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 185 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  28.26 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2286  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.23 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>